aif.ru counter
120

Генетики расшифровали скрытый код в человеческой ДНК

Изучение механизма сплайсинга и, в частности, прогнозирование его результатов в разных тканях организма оказалось...

Британские и канадские ученые составили словарь «тайнописи», скрытой в коде ДНК, которая позволяет с помощью одного и того же гена получать «инструкции» для синтеза в клетках разных белков, говорится в статье, которая будет опубликована в завтрашнем номере журнала Nature. У сложных организмов последовательности элементов ДНК — нуклеотидов, содержащие информацию для синтеза тех или иных белков (эксоны), чередуются с «пустыми» участками (интронами).

В процессе синтеза белка пустые участки удаляются, а информативные «склеиваются», однако это удаление и склейка может происходить разными способами. Разным получается и результат синтеза — белок. Этот процесс — альтернативный сплайсинг — дает различным клеткам возможность по-разному «прочитать» один и тот же ген, что позволяет существенно увеличить информационную емкость генома. Изучение механизма сплайсинга и, в частности, прогнозирование его результатов в разных тканях организма оказалось достаточно трудной задачей.

Исследование под руководством профессоров Брендана Фрея (Brendan Frey) и Бенджамина Бленкоу (Benjamin Blencowe) из университета Торонто, по словам его авторов, представляет собой описание «кода сплайсинга», «словаря» комбинаций из сотен характеристик РНК и результатов сплайсинга для большого количества эксонов. «Человеческая ДНК содержит 22 тысячи генов. Может показаться, что это много, но только если не учесть, что у тополя их 45 тысяч. Мы хотели понять, как информация, нужная для того, чтобы создать нечто такое сложное, как человеческий мозг, может быть закодирована в относительно небольшом количестве генов. Мы открыли скрытый код внутри ДНК, который клетки живых организмов используют, чтобы получить из 20 тысяч генов сотни тысяч генетических сообщений, переставляя их части», — сказал Фрей, которого цитирует пресс-служба университета.

Исследователи собрали информацию о включении или удалении более трех тысяч эксонов м-РНК в четырех типах ткани у мышей, а также данные о других характеристиках этих РНК. Затем с помощью компьютерной модели они определили, какие комбинации характеристик лучше всего объясняют специфические для конкретного типа ткани результаты альтернативного сплайсинга.

По мнению разработчиков модели, с учетом сложности задачи им удалось получить достаточно точные результаты. В частности, система успешно предсказывала изменения в комбинациях эксонов для конкретных пар тканей. Кроме того, полученный код предполагает, что включение эксонов, которые приводят к образованию процессированных или «обрезанных» белков, часто служит механизмом регуляции активности генов в процессе перехода от тканей эмбриона к взрослым тканям. «Работу… лучше рассматривать как открытие первого фрагмента гораздо более крупного „Розеттского камня“, необходимого для расшифровки альтернативных сообщений нашего генома. Ожидаемая волна обширных массивов данных, созданных с применением высокопроизводительных технологий, должна вскоре предоставить возможности уточнения кода», — заключают в своем комментарии к статье коллеги авторов Рамон Техедор (Ramon Tejedor) и Хуан Валькарсел (Juan Valcarcel) из университета Помпеу Фабра (Испания).

Смотрите также:



Оставить комментарий
Вход
Комментарии (0)

  1. Пока никто не оставил здесь свой комментарий. Станьте первым.


Все комментарии Оставить свой комментарий

Актуальные вопросы

  1. Кто такая Мария Гончарук?
  2. Что могло стать причиной пожара в детском палаточном лагере «Холдоми»?
  3. Как выбрать фотоаппарат и кому подойдет «мыльница», а кому — «беззеркалка»?


Самое интересное в регионах
Роскачество
САМОЕ ИНТЕРЕСНОЕ В СОЦСЕТЯХ